昆明動物所等在蝴蝶基因組研究中取得進展
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蝴蝶因其在自然界中多姿多彩的變異,自達爾文時期以來就是進化研究的好材料。然而,長期以來其高雜合的基因組難以解析,對其也缺乏有效的遺傳操作技術(shù)體系,極大地限制了蝴蝶在進化學(xué)研究的深入廣泛應(yīng)用。
為了使蝴蝶成為研究宏觀形態(tài)進化遺傳基礎(chǔ)的新模式生物,中國科學(xué)院昆明動物研究所的基因起源課題組與深圳華大基因研究院和美國芝加哥大學(xué)等單位合作,利用雜合組裝的方法攻克了高雜合基因組難以組裝的難題,獲得了柑橘鳳蝶(Papilio xuthus)和金鳳蝶(Papilio machaon)兩個近緣種的高質(zhì)量參考基因組。結(jié)合比較基因組學(xué)和轉(zhuǎn)錄組學(xué)分析發(fā)現(xiàn)了一些在蝴蝶適應(yīng)進化和分化中可能起著重要作用的基因。
在成功解析基因組的基礎(chǔ)上,他們利用CRISPR/Cas9基因編輯技術(shù),以三個與形態(tài)有關(guān)的基因Abdominal-B、ebony和frizzled作為案例,首次在蝴蝶中成功實現(xiàn)了CRISPR/Cas9的基因編輯,觀察到了各基因的形態(tài)突變體。該研究結(jié)果為今后的蝴蝶研究提供了重要的數(shù)據(jù)資源和技術(shù)平臺,奠定了蝴蝶作為優(yōu)秀模型探討形態(tài)進化的關(guān)鍵技術(shù)基礎(chǔ)。
該研究結(jié)果于中國時間9月10日在線發(fā)表于Nature Communications (doi:10.1038/ncomms9212) ?;蚱鹪凑n題組的李學(xué)燕和劉貴春、深圳華大的范丁丁和張璐、美國芝加哥大學(xué)的張蔚為該論文的共同第一作者,昆明動物所研究員王文、芝加哥大學(xué)教授Marcus R. Kronforst、深圳華大研究員張國捷和王俊為該論文的共同通訊作者。
該研究得到國家自然科學(xué)基金委創(chuàng)新群體項目、中國科學(xué)院先導(dǎo)專項(B類)和云南省科技廳項目資助
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